近年来，南海所质量与标准化技术研究中心在广泛收集、研究国内外有关水产品标准和法规的基础上，如世界卫生组织/联合国粮农组织（WHO/FAO）下属的国际食品法典委员会（CAC）有关水产方面的产品标准和操作规范、美国FDA有关规定、欧盟EEC系列强制性法规、日本厚生省法规，大力开展制定标准和研究标准技术课题工作，取得了喜人的成绩。特别是在2005～2006年，成绩更加突出，两年间中心共承担制定农业部行业标准8项，作为广东省渔业标准技术归口单位积极承担广东省地方标准，负责全省渔业标准的规划，两年来承担制定的广东省标准37项，占广东省渔业标准制定的57%。由该中心制定的标准在2006年发布的有33项,其中行业标准3项、广东省地方标准30项。

此外，作为广东省水产品加工与质量安全控制委员会成员单位，广东省FDA成员单位，中心积极参与广东省地方质量安全监督与突发事件处理，如孔雀石绿事件、毒咸鱼事件、甲基睪丸酮事件、硝基呋喃代谢物超标事件等，起草广东省水产品质量安全监督政策建议，积极参与地方质量安全培训与宣传工作，先后6次联合广东省水产技术推广站、广东省渔业技能培训站在省渔业局的组织下为水产养殖户及加工企业培训无公害水产品生产基础知识、无公害水产品养殖和加工过程质量控制情况等，在全省范围内培训600多人次。

经过几年的培育，该所水产品质量标准研究工作已拓展出一条新路子，并将继续拓展研究范围和研究深度，为我国水产品质量安全控制提供技术支撑。